自噬是一种进化上保守的分解代谢性胞内过程,其中胞浆大分子、聚集的蛋白质、受损的细胞器或病原体被运送到溶酶体进行降解。其在细胞发育、功能和稳态中发挥着重要作用,自噬紊乱会导致神经退行性疾病、代谢疾病和癌症。先前的证据表明,自噬水平与肿瘤患者的预后相关。
该研究从癌症基因组图谱 (TCGA) 数据库下载了 374 例 OC 患者的基因转录组数据,通过单样本基因集富集分析 (ssGSEA),基因集富集分析 (GSEA)、ESTIMATE 和 CIBERSORT等方法分析了自噬相关基因同卵巢癌患者预后及免疫治疗反应性具有关联性的自噬相关基因。发现ZFYVE1、AMBRA1、LAMP2等八个自噬核心基因与卵巢癌患者的不良预后具有明确的关联性(图1)。通过这些基因建立了风险因子评分系统,该评分能够预测患者的预后(图2)和免疫治疗反应性(图3)。这为预测分析卵巢癌患者预后和免疫检查点抑制剂 (ICIs) 治疗效果提供了分子靶点。

图1.自噬相关分子的表达水平同患者预后的关联性分析

图2.自噬相关基因为基础的预后因子评分同患者预后具有明确关联性。

图3. 自噬相关基因为基础的预后因子评分同患者对免疫治疗反应性具有明确关联性
Identification of an Autophagy-Related Signature for Prognosis and Immunotherapy Response Prediction in Ovarian Cancer. Biomolecules. 2023 Feb 9;13(2):339. doi: 10.3390/biom13020339. Jinye Ding, Chunyan Wang, Yaoqi Sun, Jing Guo, Shupeng Liu, Zhongping Cheng
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